Nakon višemjesečne operacije, tim se priprema za tešku bitku kako bi osujetio osvetnički Francisov plan koji David Hartley nije uspio. Agencija mora upotrijebiti svoju snagu i hrabrost kako bi porazila neprijatelje i dobila ovu tešku bitku.
Ömer i Zehra su na ivici da nadoknade izgubljene godine i zajedno krenu iznova. Međutim, na svom putu moraće da podnesu veliku žrtvu.
Svaki kraj susreće novi početak. Završnica Agencije otvorit će vrata avanturi ispunjenoj još većim uzbuđenjem i iznenađenjima sljedeće sezone.Jagmur koja ostaje sa svojom nanom, sprema se da ide na put. Zehra i Omer koji jedno drugome izjavljuju ljubav čekajući u zatvorenoj prostoriji da ginu za svoju državu,u zagrljaju se opraštaju jedno od drugog.
Njih dvoje se nisu izvukli živi iz zgrade. Tim se oprašta od njih sa velikom tugom. Jagmur je također na završnici sa svojom nanom. Svima je teško pao njihov gubitak.Zadnja scena prikazuje Irak i dvije osobe koje leže u bolnici na krevetima i za njih se ne zna ko su.
Samo se prikazuju imena Zehre i Omera i osobe koje leže umotane u zavoj. Da li su to njih dvoje ipak preživjeli ali su u teškom stanju, ostaje nam da vidimo naredne sezone. Budite uz nas i narednu sezonu serije Organizacija. Kraj 3 sezone
